Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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RFPL4BQ6ZWI9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RFPL4BQ6ZWI9 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RFPL4BQ6ZWI9 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RFPL4BQ6ZWI9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RFPL4BQ6ZWI9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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