Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms