Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF827Q17R98 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF827Q17R98 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms