Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 614.2 ms