Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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