Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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