Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms