Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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