Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms