Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL5P13501 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms