Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KIF4AO95239 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms