Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms