Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms