Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms