Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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