Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SEMA4CQ9C0C4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SEMA4CQ9C0C4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SEMA4CQ9C0C4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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