Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKD2Q9BZL6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKD2Q9BZL6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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