Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RSPO3Q9BXY4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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