Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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UBE2E2Q96LR5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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