Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms