Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms