Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms