Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKDCCQ504Y2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms