Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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