Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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