Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSCP56915 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms