Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MANFP55145 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MANFP55145 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MANFP55145 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
MANFP55145 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MANFP55145 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms