Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms