Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCAMP43121 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCAMP43121 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms