Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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