Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms