Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms