Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJB1P25685 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms