Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CXCL2P19875 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms