Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GM2AP17900 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GM2AP17900 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms