Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms