Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms