Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms