Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms