Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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