Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNTN3Q9P232 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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