Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms