Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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