Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI66

KRTAP6-2, Keratin-associated protein 6-2, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-2Q3LI66 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP6-2Q3LI66 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms