Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms