Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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USP46P62068 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP46P62068 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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