Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSCP56915 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GSCP56915 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSCP56915 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSCP56915 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSCP56915 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSCP56915 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms