Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RECQLP46063 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RECQLP46063 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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