Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms