Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms